Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXD13P35453 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms