Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPC1P35052 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPC1P35052 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPC1P35052 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPC1P35052 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPC1P35052 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPC1P35052 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GPC1P35052 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPC1P35052 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPC1P35052 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPC1P35052 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPC1P35052 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPC1P35052 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPC1P35052 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPC1P35052 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GPC1P35052 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPC1P35052 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GPC1P35052 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GPC1P35052 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPC1P35052 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPC1P35052 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPC1P35052 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPC1P35052 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPC1P35052 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPC1P35052 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPC1P35052 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPC1P35052 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPC1P35052 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GPC1P35052 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPC1P35052 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPC1P35052 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPC1P35052 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPC1P35052 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPC1P35052 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GPC1P35052 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPC1P35052 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPC1P35052 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPC1P35052 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPC1P35052 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPC1P35052 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPC1P35052 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPC1P35052 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPC1P35052 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPC1P35052 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPC1P35052 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPC1P35052 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC1P35052 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC1P35052 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC1P35052 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC1P35052 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC1P35052 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC1P35052 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC1P35052 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC1P35052 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC1P35052 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC1P35052 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC1P35052 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC1P35052 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC1P35052 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC1P35052 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPC1P35052 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC1P35052 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC1P35052 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC1P35052 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC1P35052 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC1P35052 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC1P35052 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC1P35052 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC1P35052 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC1P35052 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC1P35052 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC1P35052 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC1P35052 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC1P35052 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC1P35052 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC1P35052 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC1P35052 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPC1P35052 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC1P35052 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC1P35052 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC1P35052 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC1P35052 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC1P35052 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC1P35052 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC1P35052 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC1P35052 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC1P35052 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC1P35052 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC1P35052 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC1P35052 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC1P35052 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC1P35052 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC1P35052 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC1P35052 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC1P35052 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC1P35052 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPC1P35052 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC1P35052 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC1P35052 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC1P35052 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms