Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCSK1P29120 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms