Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF8P28908 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms