Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD34P28906 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD34P28906 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD34P28906 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD34P28906 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD34P28906 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD34P28906 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD34P28906 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD34P28906 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD34P28906 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD34P28906 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD34P28906 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD34P28906 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD34P28906 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD34P28906 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD34P28906 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD34P28906 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD34P28906 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD34P28906 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD34P28906 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD34P28906 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD34P28906 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD34P28906 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD34P28906 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD34P28906 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD34P28906 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD34P28906 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD34P28906 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD34P28906 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD34P28906 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD34P28906 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD34P28906 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CD34P28906 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD34P28906 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD34P28906 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD34P28906 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD34P28906 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD34P28906 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD34P28906 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD34P28906 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD34P28906 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD34P28906 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD34P28906 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD34P28906 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD34P28906 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD34P28906 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD34P28906 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD34P28906 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD34P28906 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD34P28906 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD34P28906 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD34P28906 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD34P28906 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD34P28906 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD34P28906 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD34P28906 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD34P28906 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD34P28906 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD34P28906 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD34P28906 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD34P28906 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD34P28906 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CD34P28906 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD34P28906 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CD34P28906 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD34P28906 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD34P28906 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD34P28906 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD34P28906 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD34P28906 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD34P28906 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD34P28906 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD34P28906 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD34P28906 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD34P28906 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD34P28906 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD34P28906 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CD34P28906 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD34P28906 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD34P28906 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD34P28906 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD34P28906 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD34P28906 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD34P28906 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD34P28906 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CD34P28906 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD34P28906 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD34P28906 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD34P28906 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD34P28906 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD34P28906 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD34P28906 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CD34P28906 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD34P28906 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD34P28906 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD34P28906 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CD34P28906 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD34P28906 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD34P28906 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD34P28906 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms