Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLNP26678 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLNP26678 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLNP26678 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLNP26678 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLNP26678 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLNP26678 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLNP26678 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLNP26678 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLNP26678 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLNP26678 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLNP26678 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLNP26678 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLNP26678 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLNP26678 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLNP26678 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLNP26678 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLNP26678 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLNP26678 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLNP26678 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLNP26678 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLNP26678 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLNP26678 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLNP26678 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLNP26678 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLNP26678 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLNP26678 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLNP26678 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLNP26678 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PLNP26678 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLNP26678 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLNP26678 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLNP26678 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLNP26678 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLNP26678 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLNP26678 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLNP26678 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLNP26678 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLNP26678 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLNP26678 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLNP26678 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLNP26678 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLNP26678 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLNP26678 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLNP26678 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLNP26678 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLNP26678 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLNP26678 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLNP26678 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLNP26678 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLNP26678 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLNP26678 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLNP26678 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLNP26678 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms