Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTX3P26022 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTX3P26022 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTX3P26022 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTX3P26022 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTX3P26022 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTX3P26022 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTX3P26022 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTX3P26022 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTX3P26022 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTX3P26022 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTX3P26022 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTX3P26022 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTX3P26022 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTX3P26022 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTX3P26022 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTX3P26022 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTX3P26022 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTX3P26022 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTX3P26022 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTX3P26022 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTX3P26022 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTX3P26022 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTX3P26022 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTX3P26022 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTX3P26022 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTX3P26022 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTX3P26022 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTX3P26022 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTX3P26022 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTX3P26022 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTX3P26022 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTX3P26022 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTX3P26022 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTX3P26022 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTX3P26022 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTX3P26022 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTX3P26022 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTX3P26022 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTX3P26022 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTX3P26022 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTX3P26022 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTX3P26022 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTX3P26022 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTX3P26022 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTX3P26022 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTX3P26022 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTX3P26022 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTX3P26022 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTX3P26022 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTX3P26022 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTX3P26022 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTX3P26022 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTX3P26022 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTX3P26022 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTX3P26022 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTX3P26022 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTX3P26022 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTX3P26022 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTX3P26022 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTX3P26022 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTX3P26022 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTX3P26022 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTX3P26022 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTX3P26022 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTX3P26022 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTX3P26022 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTX3P26022 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTX3P26022 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTX3P26022 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTX3P26022 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTX3P26022 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTX3P26022 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTX3P26022 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTX3P26022 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTX3P26022 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTX3P26022 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTX3P26022 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTX3P26022 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTX3P26022 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTX3P26022 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTX3P26022 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTX3P26022 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTX3P26022 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTX3P26022 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTX3P26022 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PTX3P26022 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms