Protein–RNA interactions for Protein: P25787

PSMA2, Proteasome subunit alpha type-2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA2P25787 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA2P25787 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMA2P25787 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMA2P25787 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMA2P25787 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMA2P25787 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMA2P25787 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMA2P25787 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms