Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms