Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRHP20396 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRHP20396 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRHP20396 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRHP20396 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRHP20396 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRHP20396 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRHP20396 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRHP20396 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRHP20396 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRHP20396 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRHP20396 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRHP20396 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRHP20396 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRHP20396 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRHP20396 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRHP20396 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
TRHP20396 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRHP20396 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
TRHP20396 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRHP20396 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRHP20396 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRHP20396 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRHP20396 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRHP20396 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRHP20396 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRHP20396 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRHP20396 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRHP20396 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRHP20396 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRHP20396 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRHP20396 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRHP20396 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRHP20396 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
TRHP20396 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRHP20396 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRHP20396 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRHP20396 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
TRHP20396 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRHP20396 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRHP20396 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRHP20396 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRHP20396 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRHP20396 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRHP20396 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRHP20396 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRHP20396 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRHP20396 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRHP20396 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRHP20396 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRHP20396 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRHP20396 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRHP20396 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRHP20396 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRHP20396 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
TRHP20396 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRHP20396 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRHP20396 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRHP20396 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRHP20396 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRHP20396 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRHP20396 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRHP20396 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRHP20396 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRHP20396 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRHP20396 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRHP20396 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
TRHP20396 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRHP20396 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRHP20396 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRHP20396 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRHP20396 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRHP20396 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
TRHP20396 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRHP20396 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRHP20396 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRHP20396 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRHP20396 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRHP20396 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRHP20396 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRHP20396 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRHP20396 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRHP20396 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRHP20396 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRHP20396 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRHP20396 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
TRHP20396 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TRHP20396 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
TRHP20396 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TRHP20396 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
TRHP20396 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TRHP20396 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TRHP20396 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TRHP20396 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TRHP20396 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRHP20396 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRHP20396 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRHP20396 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRHP20396 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRHP20396 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms