Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HLA-DPA1P20036 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms