Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELK1P19419 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELK1P19419 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELK1P19419 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELK1P19419 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ELK1P19419 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELK1P19419 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELK1P19419 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELK1P19419 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELK1P19419 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELK1P19419 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELK1P19419 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELK1P19419 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ELK1P19419 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELK1P19419 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELK1P19419 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELK1P19419 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELK1P19419 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELK1P19419 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELK1P19419 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELK1P19419 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELK1P19419 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELK1P19419 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELK1P19419 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELK1P19419 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELK1P19419 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELK1P19419 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELK1P19419 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELK1P19419 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELK1P19419 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELK1P19419 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELK1P19419 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELK1P19419 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELK1P19419 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELK1P19419 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELK1P19419 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELK1P19419 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELK1P19419 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELK1P19419 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELK1P19419 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELK1P19419 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ELK1P19419 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELK1P19419 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELK1P19419 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELK1P19419 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELK1P19419 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELK1P19419 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELK1P19419 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELK1P19419 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELK1P19419 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELK1P19419 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELK1P19419 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELK1P19419 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELK1P19419 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELK1P19419 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELK1P19419 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELK1P19419 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELK1P19419 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELK1P19419 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELK1P19419 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELK1P19419 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELK1P19419 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELK1P19419 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELK1P19419 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELK1P19419 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELK1P19419 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELK1P19419 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELK1P19419 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELK1P19419 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELK1P19419 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELK1P19419 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELK1P19419 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELK1P19419 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELK1P19419 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELK1P19419 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELK1P19419 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELK1P19419 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELK1P19419 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELK1P19419 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELK1P19419 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELK1P19419 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELK1P19419 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELK1P19419 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELK1P19419 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELK1P19419 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELK1P19419 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELK1P19419 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELK1P19419 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELK1P19419 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELK1P19419 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELK1P19419 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELK1P19419 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ELK1P19419 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELK1P19419 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELK1P19419 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELK1P19419 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELK1P19419 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELK1P19419 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELK1P19419 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELK1P19419 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms