Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2CP19387 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR2CP19387 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR2CP19387 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR2CP19387 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2CP19387 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2CP19387 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2CP19387 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2CP19387 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2CP19387 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2CP19387 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2CP19387 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2CP19387 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2CP19387 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2CP19387 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2CP19387 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2CP19387 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2CP19387 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLR2CP19387 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2CP19387 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2CP19387 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2CP19387 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2CP19387 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2CP19387 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2CP19387 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2CP19387 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2CP19387 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2CP19387 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2CP19387 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2CP19387 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2CP19387 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2CP19387 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2CP19387 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2CP19387 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2CP19387 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2CP19387 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2CP19387 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2CP19387 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2CP19387 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2CP19387 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2CP19387 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2CP19387 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2CP19387 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2CP19387 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2CP19387 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2CP19387 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2CP19387 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLR2CP19387 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2CP19387 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2CP19387 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2CP19387 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2CP19387 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2CP19387 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2CP19387 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2CP19387 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2CP19387 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2CP19387 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2CP19387 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2CP19387 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2CP19387 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2CP19387 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2CP19387 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms