Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms