Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHN1P15882 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHN1P15882 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHN1P15882 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHN1P15882 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHN1P15882 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHN1P15882 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHN1P15882 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHN1P15882 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHN1P15882 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHN1P15882 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHN1P15882 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHN1P15882 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHN1P15882 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHN1P15882 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHN1P15882 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHN1P15882 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHN1P15882 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHN1P15882 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHN1P15882 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHN1P15882 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHN1P15882 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHN1P15882 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHN1P15882 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHN1P15882 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHN1P15882 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHN1P15882 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHN1P15882 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHN1P15882 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHN1P15882 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHN1P15882 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHN1P15882 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHN1P15882 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHN1P15882 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHN1P15882 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHN1P15882 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHN1P15882 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHN1P15882 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHN1P15882 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHN1P15882 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHN1P15882 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHN1P15882 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHN1P15882 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHN1P15882 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHN1P15882 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHN1P15882 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHN1P15882 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHN1P15882 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHN1P15882 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHN1P15882 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHN1P15882 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHN1P15882 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHN1P15882 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHN1P15882 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHN1P15882 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHN1P15882 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHN1P15882 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHN1P15882 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHN1P15882 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHN1P15882 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHN1P15882 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHN1P15882 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHN1P15882 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHN1P15882 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHN1P15882 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHN1P15882 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHN1P15882 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHN1P15882 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHN1P15882 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHN1P15882 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHN1P15882 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHN1P15882 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHN1P15882 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHN1P15882 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHN1P15882 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHN1P15882 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHN1P15882 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHN1P15882 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHN1P15882 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHN1P15882 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHN1P15882 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHN1P15882 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHN1P15882 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHN1P15882 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHN1P15882 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHN1P15882 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHN1P15882 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHN1P15882 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHN1P15882 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHN1P15882 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHN1P15882 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHN1P15882 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHN1P15882 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHN1P15882 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHN1P15882 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHN1P15882 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHN1P15882 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHN1P15882 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHN1P15882 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHN1P15882 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms