Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAV1P15498 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VAV1P15498 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VAV1P15498 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VAV1P15498 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAV1P15498 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAV1P15498 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAV1P15498 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAV1P15498 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAV1P15498 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAV1P15498 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAV1P15498 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAV1P15498 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAV1P15498 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAV1P15498 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAV1P15498 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAV1P15498 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VAV1P15498 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VAV1P15498 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAV1P15498 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAV1P15498 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAV1P15498 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV1P15498 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV1P15498 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV1P15498 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV1P15498 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV1P15498 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV1P15498 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV1P15498 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV1P15498 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV1P15498 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV1P15498 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV1P15498 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VAV1P15498 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VAV1P15498 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VAV1P15498 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV1P15498 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV1P15498 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV1P15498 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV1P15498 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV1P15498 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV1P15498 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV1P15498 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV1P15498 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV1P15498 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV1P15498 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV1P15498 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV1P15498 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV1P15498 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV1P15498 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV1P15498 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV1P15498 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV1P15498 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV1P15498 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV1P15498 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV1P15498 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV1P15498 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV1P15498 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV1P15498 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV1P15498 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV1P15498 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV1P15498 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV1P15498 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV1P15498 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV1P15498 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV1P15498 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV1P15498 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV1P15498 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV1P15498 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV1P15498 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV1P15498 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV1P15498 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV1P15498 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV1P15498 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV1P15498 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV1P15498 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV1P15498 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV1P15498 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV1P15498 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV1P15498 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV1P15498 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV1P15498 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV1P15498 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV1P15498 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV1P15498 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV1P15498 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms