Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF2P15336 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF2P15336 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF2P15336 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF2P15336 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF2P15336 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF2P15336 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF2P15336 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF2P15336 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF2P15336 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF2P15336 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF2P15336 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF2P15336 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF2P15336 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF2P15336 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF2P15336 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF2P15336 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF2P15336 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF2P15336 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF2P15336 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF2P15336 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF2P15336 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF2P15336 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF2P15336 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF2P15336 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF2P15336 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF2P15336 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF2P15336 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF2P15336 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF2P15336 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF2P15336 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF2P15336 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF2P15336 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF2P15336 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF2P15336 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATF2P15336 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATF2P15336 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATF2P15336 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF2P15336 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF2P15336 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF2P15336 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF2P15336 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF2P15336 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF2P15336 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF2P15336 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF2P15336 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF2P15336 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF2P15336 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF2P15336 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF2P15336 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF2P15336 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF2P15336 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF2P15336 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF2P15336 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF2P15336 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF2P15336 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF2P15336 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF2P15336 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF2P15336 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF2P15336 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF2P15336 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF2P15336 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF2P15336 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF2P15336 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF2P15336 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF2P15336 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF2P15336 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF2P15336 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF2P15336 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF2P15336 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF2P15336 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF2P15336 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF2P15336 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF2P15336 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF2P15336 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF2P15336 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF2P15336 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF2P15336 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF2P15336 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF2P15336 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF2P15336 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF2P15336 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF2P15336 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF2P15336 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF2P15336 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF2P15336 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF2P15336 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF2P15336 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF2P15336 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF2P15336 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF2P15336 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF2P15336 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF2P15336 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF2P15336 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF2P15336 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF2P15336 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF2P15336 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF2P15336 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF2P15336 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF2P15336 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms