Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
GABRA1P14867 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRA1P14867 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms