Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNAP12004 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNAP12004 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNAP12004 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNAP12004 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNAP12004 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNAP12004 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNAP12004 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNAP12004 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNAP12004 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNAP12004 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNAP12004 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNAP12004 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNAP12004 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNAP12004 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNAP12004 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNAP12004 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNAP12004 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNAP12004 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNAP12004 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNAP12004 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNAP12004 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNAP12004 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNAP12004 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNAP12004 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNAP12004 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNAP12004 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNAP12004 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNAP12004 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNAP12004 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNAP12004 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNAP12004 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNAP12004 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNAP12004 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNAP12004 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNAP12004 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNAP12004 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNAP12004 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNAP12004 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNAP12004 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNAP12004 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNAP12004 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNAP12004 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNAP12004 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNAP12004 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNAP12004 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNAP12004 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNAP12004 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNAP12004 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNAP12004 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNAP12004 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNAP12004 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNAP12004 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNAP12004 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNAP12004 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNAP12004 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNAP12004 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNAP12004 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNAP12004 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNAP12004 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNAP12004 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNAP12004 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNAP12004 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNAP12004 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNAP12004 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNAP12004 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNAP12004 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNAP12004 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCNAP12004 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCNAP12004 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCNAP12004 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCNAP12004 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCNAP12004 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCNAP12004 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCNAP12004 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCNAP12004 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCNAP12004 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCNAP12004 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCNAP12004 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCNAP12004 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCNAP12004 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCNAP12004 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PCNAP12004 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PCNAP12004 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCNAP12004 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCNAP12004 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCNAP12004 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCNAP12004 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCNAP12004 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCNAP12004 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCNAP12004 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCNAP12004 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCNAP12004 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCNAP12004 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCNAP12004 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCNAP12004 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PCNAP12004 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCNAP12004 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCNAP12004 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCNAP12004 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms