Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP1P11387 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP1P11387 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP1P11387 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP1P11387 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP1P11387 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP1P11387 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP1P11387 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP1P11387 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP1P11387 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP1P11387 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP1P11387 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP1P11387 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP1P11387 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP1P11387 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP1P11387 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP1P11387 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP1P11387 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP1P11387 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP1P11387 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP1P11387 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP1P11387 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP1P11387 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOP1P11387 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOP1P11387 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOP1P11387 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOP1P11387 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOP1P11387 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOP1P11387 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TOP1P11387 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOP1P11387 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOP1P11387 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOP1P11387 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOP1P11387 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOP1P11387 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOP1P11387 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOP1P11387 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TOP1P11387 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOP1P11387 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOP1P11387 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TOP1P11387 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TOP1P11387 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1P11387 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1P11387 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1P11387 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1P11387 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1P11387 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1P11387 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1P11387 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1P11387 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1P11387 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1P11387 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1P11387 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1P11387 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP1P11387 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP1P11387 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP1P11387 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP1P11387 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP1P11387 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP1P11387 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP1P11387 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP1P11387 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP1P11387 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP1P11387 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP1P11387 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP1P11387 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP1P11387 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP1P11387 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP1P11387 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP1P11387 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1P11387 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1P11387 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1P11387 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1P11387 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1P11387 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1P11387 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1P11387 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1P11387 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1P11387 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1P11387 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP1P11387 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP1P11387 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP1P11387 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP1P11387 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP1P11387 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP1P11387 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP1P11387 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP1P11387 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP1P11387 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP1P11387 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP1P11387 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP1P11387 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP1P11387 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP1P11387 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP1P11387 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP1P11387 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP1P11387 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP1P11387 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP1P11387 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP1P11387 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms