Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2P10911 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2P10911 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2P10911 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2P10911 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MCF2P10911 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2P10911 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2P10911 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2P10911 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2P10911 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2P10911 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2P10911 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2P10911 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2P10911 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2P10911 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2P10911 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2P10911 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2P10911 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2P10911 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2P10911 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2P10911 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2P10911 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2P10911 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2P10911 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2P10911 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2P10911 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2P10911 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2P10911 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2P10911 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCF2P10911 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCF2P10911 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCF2P10911 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCF2P10911 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCF2P10911 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCF2P10911 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCF2P10911 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCF2P10911 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2P10911 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2P10911 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2P10911 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2P10911 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2P10911 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2P10911 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2P10911 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2P10911 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2P10911 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2P10911 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2P10911 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2P10911 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2P10911 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2P10911 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2P10911 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2P10911 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2P10911 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MCF2P10911 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCF2P10911 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCF2P10911 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCF2P10911 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCF2P10911 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCF2P10911 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCF2P10911 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCF2P10911 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCF2P10911 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCF2P10911 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCF2P10911 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCF2P10911 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCF2P10911 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2P10911 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2P10911 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2P10911 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2P10911 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2P10911 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2P10911 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2P10911 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2P10911 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2P10911 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2P10911 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2P10911 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2P10911 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2P10911 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2P10911 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2P10911 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2P10911 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2P10911 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCF2P10911 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCF2P10911 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCF2P10911 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MCF2P10911 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCF2P10911 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCF2P10911 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCF2P10911 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCF2P10911 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2P10911 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2P10911 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2P10911 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2P10911 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2P10911 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2P10911 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2P10911 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2P10911 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms