Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM13P0DJ93 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms