Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VIL1P09327 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VIL1P09327 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VIL1P09327 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VIL1P09327 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VIL1P09327 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VIL1P09327 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VIL1P09327 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VIL1P09327 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VIL1P09327 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VIL1P09327 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIL1P09327 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIL1P09327 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIL1P09327 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIL1P09327 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIL1P09327 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIL1P09327 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIL1P09327 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIL1P09327 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIL1P09327 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIL1P09327 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIL1P09327 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VIL1P09327 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIL1P09327 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIL1P09327 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIL1P09327 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VIL1P09327 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VIL1P09327 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VIL1P09327 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VIL1P09327 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VIL1P09327 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VIL1P09327 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VIL1P09327 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIL1P09327 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIL1P09327 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIL1P09327 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIL1P09327 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
VIL1P09327 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIL1P09327 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIL1P09327 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIL1P09327 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIL1P09327 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIL1P09327 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIL1P09327 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
VIL1P09327 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIL1P09327 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIL1P09327 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIL1P09327 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VIL1P09327 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VIL1P09327 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VIL1P09327 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VIL1P09327 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VIL1P09327 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VIL1P09327 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VIL1P09327 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIL1P09327 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIL1P09327 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIL1P09327 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VIL1P09327 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIL1P09327 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIL1P09327 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VIL1P09327 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VIL1P09327 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VIL1P09327 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VIL1P09327 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VIL1P09327 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VIL1P09327 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VIL1P09327 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VIL1P09327 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VIL1P09327 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VIL1P09327 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VIL1P09327 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VIL1P09327 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VIL1P09327 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
VIL1P09327 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VIL1P09327 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VIL1P09327 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VIL1P09327 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VIL1P09327 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VIL1P09327 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VIL1P09327 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms