Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOEP02649 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOEP02649 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOEP02649 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOEP02649 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOEP02649 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOEP02649 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
APOEP02649 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOEP02649 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOEP02649 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOEP02649 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOEP02649 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOEP02649 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOEP02649 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOEP02649 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOEP02649 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
APOEP02649 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOEP02649 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOEP02649 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOEP02649 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOEP02649 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOEP02649 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOEP02649 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOEP02649 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOEP02649 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOEP02649 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOEP02649 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOEP02649 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOEP02649 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOEP02649 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOEP02649 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOEP02649 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOEP02649 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOEP02649 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOEP02649 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOEP02649 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOEP02649 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOEP02649 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOEP02649 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOEP02649 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOEP02649 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOEP02649 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOEP02649 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOEP02649 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOEP02649 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOEP02649 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOEP02649 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOEP02649 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOEP02649 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOEP02649 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOEP02649 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOEP02649 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOEP02649 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOEP02649 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOEP02649 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APOEP02649 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOEP02649 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOEP02649 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOEP02649 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOEP02649 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOEP02649 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOEP02649 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOEP02649 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOEP02649 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOEP02649 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOEP02649 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOEP02649 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOEP02649 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOEP02649 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOEP02649 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOEP02649 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOEP02649 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOEP02649 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
APOEP02649 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOEP02649 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOEP02649 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOEP02649 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOEP02649 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOEP02649 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOEP02649 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOEP02649 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms