Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11BO96011 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11BO96011 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms