Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRUB2O95900 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms