Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD4O95243 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD4O95243 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD4O95243 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD4O95243 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD4O95243 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD4O95243 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD4O95243 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD4O95243 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD4O95243 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD4O95243 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD4O95243 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD4O95243 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD4O95243 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD4O95243 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD4O95243 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD4O95243 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD4O95243 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD4O95243 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD4O95243 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD4O95243 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD4O95243 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD4O95243 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD4O95243 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD4O95243 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD4O95243 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD4O95243 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD4O95243 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD4O95243 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD4O95243 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD4O95243 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD4O95243 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD4O95243 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD4O95243 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MBD4O95243 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MBD4O95243 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MBD4O95243 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MBD4O95243 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MBD4O95243 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MBD4O95243 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MBD4O95243 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MBD4O95243 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MBD4O95243 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MBD4O95243 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MBD4O95243 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MBD4O95243 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MBD4O95243 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MBD4O95243 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MBD4O95243 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MBD4O95243 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MBD4O95243 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MBD4O95243 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MBD4O95243 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MBD4O95243 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MBD4O95243 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MBD4O95243 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MBD4O95243 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MBD4O95243 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MBD4O95243 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MBD4O95243 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MBD4O95243 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MBD4O95243 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MBD4O95243 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MBD4O95243 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MBD4O95243 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MBD4O95243 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD4O95243 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD4O95243 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD4O95243 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD4O95243 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD4O95243 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD4O95243 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD4O95243 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD4O95243 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD4O95243 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD4O95243 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD4O95243 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD4O95243 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD4O95243 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD4O95243 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD4O95243 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD4O95243 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD4O95243 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD4O95243 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD4O95243 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD4O95243 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD4O95243 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD4O95243 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD4O95243 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD4O95243 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD4O95243 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD4O95243 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD4O95243 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD4O95243 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD4O95243 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD4O95243 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD4O95243 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD4O95243 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD4O95243 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD4O95243 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms