Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms