Protein–RNA interactions for Protein: O75064

DENND4B, DENN domain-containing protein 4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4BO75064 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
DENND4BO75064 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
DENND4BO75064 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DENND4BO75064 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
DENND4BO75064 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DENND4BO75064 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DENND4BO75064 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
DENND4BO75064 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
DENND4BO75064 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DENND4BO75064 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
DENND4BO75064 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DENND4BO75064 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DENND4BO75064 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DENND4BO75064 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
DENND4BO75064 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
DENND4BO75064 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
DENND4BO75064 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
DENND4BO75064 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms