Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LANCL1O43813 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms