Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTAO43765 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTAO43765 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTAO43765 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTAO43765 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTAO43765 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTAO43765 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTAO43765 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTAO43765 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTAO43765 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTAO43765 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTAO43765 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTAO43765 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTAO43765 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTAO43765 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTAO43765 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTAO43765 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTAO43765 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTAO43765 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTAO43765 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTAO43765 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTAO43765 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTAO43765 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTAO43765 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTAO43765 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTAO43765 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTAO43765 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTAO43765 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTAO43765 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTAO43765 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTAO43765 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTAO43765 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTAO43765 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGTAO43765 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGTAO43765 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGTAO43765 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGTAO43765 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGTAO43765 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGTAO43765 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGTAO43765 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGTAO43765 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGTAO43765 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SGTAO43765 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SGTAO43765 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTAO43765 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTAO43765 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTAO43765 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTAO43765 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTAO43765 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTAO43765 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTAO43765 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTAO43765 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTAO43765 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTAO43765 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTAO43765 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTAO43765 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTAO43765 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTAO43765 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTAO43765 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTAO43765 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTAO43765 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTAO43765 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGTAO43765 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGTAO43765 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGTAO43765 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGTAO43765 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SGTAO43765 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGTAO43765 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGTAO43765 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGTAO43765 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTAO43765 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGTAO43765 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGTAO43765 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGTAO43765 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGTAO43765 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGTAO43765 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGTAO43765 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGTAO43765 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGTAO43765 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGTAO43765 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGTAO43765 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms