Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN6O43657 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms