Protein–RNA interactions for Protein: O43612

HCRT, Orexin, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCRTO43612 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCRTO43612 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCRTO43612 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCRTO43612 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCRTO43612 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCRTO43612 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCRTO43612 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCRTO43612 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCRTO43612 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCRTO43612 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCRTO43612 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCRTO43612 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCRTO43612 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCRTO43612 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCRTO43612 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCRTO43612 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCRTO43612 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCRTO43612 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCRTO43612 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCRTO43612 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCRTO43612 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCRTO43612 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCRTO43612 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCRTO43612 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCRTO43612 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCRTO43612 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCRTO43612 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HCRTO43612 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCRTO43612 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCRTO43612 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCRTO43612 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCRTO43612 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCRTO43612 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCRTO43612 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCRTO43612 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCRTO43612 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCRTO43612 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HCRTO43612 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCRTO43612 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCRTO43612 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCRTO43612 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCRTO43612 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCRTO43612 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCRTO43612 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCRTO43612 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCRTO43612 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCRTO43612 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCRTO43612 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCRTO43612 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCRTO43612 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCRTO43612 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCRTO43612 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCRTO43612 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCRTO43612 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCRTO43612 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCRTO43612 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCRTO43612 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCRTO43612 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCRTO43612 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCRTO43612 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCRTO43612 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCRTO43612 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCRTO43612 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCRTO43612 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCRTO43612 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCRTO43612 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCRTO43612 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCRTO43612 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCRTO43612 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCRTO43612 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCRTO43612 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCRTO43612 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCRTO43612 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HCRTO43612 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCRTO43612 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCRTO43612 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCRTO43612 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCRTO43612 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCRTO43612 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCRTO43612 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCRTO43612 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCRTO43612 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCRTO43612 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCRTO43612 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCRTO43612 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCRTO43612 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCRTO43612 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCRTO43612 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCRTO43612 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCRTO43612 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCRTO43612 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCRTO43612 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCRTO43612 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCRTO43612 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCRTO43612 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCRTO43612 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCRTO43612 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCRTO43612 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCRTO43612 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HCRTO43612 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms