Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENRO43583 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENRO43583 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENRO43583 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENRO43583 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENRO43583 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENRO43583 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENRO43583 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENRO43583 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENRO43583 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENRO43583 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENRO43583 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENRO43583 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENRO43583 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENRO43583 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENRO43583 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENRO43583 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENRO43583 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENRO43583 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENRO43583 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENRO43583 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENRO43583 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENRO43583 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENRO43583 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENRO43583 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENRO43583 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENRO43583 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENRO43583 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENRO43583 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENRO43583 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENRO43583 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENRO43583 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENRO43583 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DENRO43583 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DENRO43583 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DENRO43583 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DENRO43583 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DENRO43583 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DENRO43583 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DENRO43583 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DENRO43583 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DENRO43583 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DENRO43583 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DENRO43583 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DENRO43583 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DENRO43583 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DENRO43583 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DENRO43583 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DENRO43583 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DENRO43583 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DENRO43583 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DENRO43583 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DENRO43583 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DENRO43583 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DENRO43583 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DENRO43583 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DENRO43583 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DENRO43583 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DENRO43583 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DENRO43583 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DENRO43583 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DENRO43583 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DENRO43583 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DENRO43583 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DENRO43583 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DENRO43583 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DENRO43583 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DENRO43583 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DENRO43583 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DENRO43583 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DENRO43583 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DENRO43583 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DENRO43583 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DENRO43583 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DENRO43583 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DENRO43583 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DENRO43583 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DENRO43583 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DENRO43583 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DENRO43583 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DENRO43583 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DENRO43583 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DENRO43583 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DENRO43583 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DENRO43583 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DENRO43583 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DENRO43583 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DENRO43583 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DENRO43583 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DENRO43583 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DENRO43583 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DENRO43583 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DENRO43583 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DENRO43583 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DENRO43583 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DENRO43583 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DENRO43583 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DENRO43583 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DENRO43583 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DENRO43583 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms