Protein–RNA interactions for Protein: O43570

CA12, Carbonic anhydrase 12, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA12O43570 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CA12O43570 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CA12O43570 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CA12O43570 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CA12O43570 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CA12O43570 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CA12O43570 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CA12O43570 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CA12O43570 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CA12O43570 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CA12O43570 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CA12O43570 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CA12O43570 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CA12O43570 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CA12O43570 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CA12O43570 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CA12O43570 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CA12O43570 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CA12O43570 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CA12O43570 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CA12O43570 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CA12O43570 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CA12O43570 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CA12O43570 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CA12O43570 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CA12O43570 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CA12O43570 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CA12O43570 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CA12O43570 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CA12O43570 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CA12O43570 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CA12O43570 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CA12O43570 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CA12O43570 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CA12O43570 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CA12O43570 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CA12O43570 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CA12O43570 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CA12O43570 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CA12O43570 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CA12O43570 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CA12O43570 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CA12O43570 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CA12O43570 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CA12O43570 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CA12O43570 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CA12O43570 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CA12O43570 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CA12O43570 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CA12O43570 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CA12O43570 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CA12O43570 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CA12O43570 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CA12O43570 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CA12O43570 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CA12O43570 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CA12O43570 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CA12O43570 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CA12O43570 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CA12O43570 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CA12O43570 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CA12O43570 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA12O43570 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA12O43570 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CA12O43570 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA12O43570 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA12O43570 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA12O43570 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CA12O43570 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA12O43570 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CA12O43570 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA12O43570 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA12O43570 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA12O43570 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA12O43570 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CA12O43570 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CA12O43570 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CA12O43570 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CA12O43570 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CA12O43570 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CA12O43570 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CA12O43570 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CA12O43570 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CA12O43570 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CA12O43570 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CA12O43570 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CA12O43570 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CA12O43570 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CA12O43570 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CA12O43570 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CA12O43570 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CA12O43570 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CA12O43570 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CA12O43570 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CA12O43570 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CA12O43570 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CA12O43570 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CA12O43570 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CA12O43570 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CA12O43570 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms