Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDC80O14777 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NDC80O14777 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDC80O14777 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDC80O14777 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDC80O14777 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDC80O14777 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDC80O14777 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDC80O14777 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDC80O14777 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC80O14777 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC80O14777 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC80O14777 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC80O14777 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC80O14777 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC80O14777 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC80O14777 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC80O14777 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC80O14777 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC80O14777 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC80O14777 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC80O14777 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC80O14777 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC80O14777 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC80O14777 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC80O14777 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC80O14777 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC80O14777 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC80O14777 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC80O14777 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC80O14777 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC80O14777 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC80O14777 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC80O14777 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC80O14777 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC80O14777 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC80O14777 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC80O14777 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC80O14777 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC80O14777 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC80O14777 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC80O14777 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC80O14777 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC80O14777 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDC80O14777 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDC80O14777 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDC80O14777 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDC80O14777 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDC80O14777 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDC80O14777 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDC80O14777 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDC80O14777 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDC80O14777 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDC80O14777 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDC80O14777 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDC80O14777 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDC80O14777 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NDC80O14777 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDC80O14777 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDC80O14777 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDC80O14777 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDC80O14777 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDC80O14777 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC80O14777 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC80O14777 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC80O14777 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC80O14777 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC80O14777 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC80O14777 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC80O14777 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC80O14777 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC80O14777 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC80O14777 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC80O14777 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC80O14777 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC80O14777 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC80O14777 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC80O14777 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC80O14777 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC80O14777 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDC80O14777 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDC80O14777 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDC80O14777 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDC80O14777 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDC80O14777 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDC80O14777 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDC80O14777 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDC80O14777 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDC80O14777 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDC80O14777 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDC80O14777 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDC80O14777 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC80O14777 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC80O14777 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC80O14777 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC80O14777 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC80O14777 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC80O14777 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC80O14777 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC80O14777 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms