Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGRNO00468 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGRNO00468 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGRNO00468 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AGRNO00468 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGRNO00468 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGRNO00468 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGRNO00468 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AGRNO00468 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGRNO00468 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGRNO00468 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGRNO00468 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGRNO00468 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AGRNO00468 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AGRNO00468 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGRNO00468 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGRNO00468 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AGRNO00468 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGRNO00468 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGRNO00468 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGRNO00468 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGRNO00468 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGRNO00468 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGRNO00468 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGRNO00468 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGRNO00468 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGRNO00468 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGRNO00468 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGRNO00468 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGRNO00468 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGRNO00468 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGRNO00468 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGRNO00468 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGRNO00468 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGRNO00468 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGRNO00468 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGRNO00468 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGRNO00468 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGRNO00468 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGRNO00468 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGRNO00468 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGRNO00468 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AGRNO00468 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGRNO00468 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGRNO00468 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGRNO00468 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGRNO00468 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGRNO00468 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGRNO00468 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGRNO00468 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGRNO00468 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGRNO00468 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGRNO00468 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AGRNO00468 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AGRNO00468 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AGRNO00468 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGRNO00468 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGRNO00468 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGRNO00468 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGRNO00468 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGRNO00468 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGRNO00468 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AGRNO00468 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGRNO00468 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGRNO00468 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGRNO00468 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGRNO00468 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGRNO00468 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AGRNO00468 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGRNO00468 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGRNO00468 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AGRNO00468 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AGRNO00468 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AGRNO00468 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGRNO00468 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGRNO00468 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGRNO00468 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGRNO00468 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AGRNO00468 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGRNO00468 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGRNO00468 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGRNO00468 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGRNO00468 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AGRNO00468 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGRNO00468 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGRNO00468 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGRNO00468 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGRNO00468 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms