Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GFRA2O00451 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms