Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC7O00311 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC7O00311 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC7O00311 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC7O00311 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC7O00311 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC7O00311 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC7O00311 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC7O00311 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC7O00311 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC7O00311 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC7O00311 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC7O00311 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC7O00311 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC7O00311 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC7O00311 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC7O00311 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC7O00311 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDC7O00311 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDC7O00311 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDC7O00311 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDC7O00311 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDC7O00311 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC7O00311 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC7O00311 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC7O00311 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC7O00311 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC7O00311 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC7O00311 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC7O00311 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC7O00311 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC7O00311 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC7O00311 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC7O00311 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC7O00311 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC7O00311 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC7O00311 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC7O00311 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC7O00311 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC7O00311 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC7O00311 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC7O00311 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC7O00311 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC7O00311 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC7O00311 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC7O00311 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC7O00311 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC7O00311 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC7O00311 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC7O00311 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC7O00311 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC7O00311 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC7O00311 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC7O00311 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC7O00311 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC7O00311 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC7O00311 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC7O00311 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC7O00311 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC7O00311 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC7O00311 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC7O00311 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC7O00311 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC7O00311 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC7O00311 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC7O00311 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC7O00311 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC7O00311 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC7O00311 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC7O00311 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC7O00311 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC7O00311 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC7O00311 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC7O00311 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC7O00311 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC7O00311 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC7O00311 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC7O00311 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC7O00311 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC7O00311 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC7O00311 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC7O00311 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC7O00311 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC7O00311 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC7O00311 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC7O00311 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC7O00311 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC7O00311 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC7O00311 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC7O00311 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC7O00311 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC7O00311 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC7O00311 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC7O00311 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC7O00311 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC7O00311 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC7O00311 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC7O00311 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC7O00311 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC7O00311 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms