Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPSO00116 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPSO00116 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPSO00116 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGPSO00116 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGPSO00116 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGPSO00116 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGPSO00116 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGPSO00116 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGPSO00116 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGPSO00116 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGPSO00116 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGPSO00116 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGPSO00116 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGPSO00116 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPSO00116 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPSO00116 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPSO00116 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPSO00116 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPSO00116 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPSO00116 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPSO00116 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPSO00116 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPSO00116 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPSO00116 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPSO00116 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPSO00116 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGPSO00116 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPSO00116 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPSO00116 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPSO00116 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPSO00116 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPSO00116 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPSO00116 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPSO00116 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPSO00116 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPSO00116 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPSO00116 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGPSO00116 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPSO00116 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPSO00116 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPSO00116 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPSO00116 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPSO00116 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPSO00116 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPSO00116 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPSO00116 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPSO00116 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPSO00116 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPSO00116 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGPSO00116 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPSO00116 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPSO00116 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPSO00116 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPSO00116 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPSO00116 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPSO00116 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPSO00116 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGPSO00116 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPSO00116 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPSO00116 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPSO00116 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPSO00116 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPSO00116 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPSO00116 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPSO00116 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPSO00116 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPSO00116 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPSO00116 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGPSO00116 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AGPSO00116 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AGPSO00116 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPSO00116 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPSO00116 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPSO00116 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPSO00116 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPSO00116 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPSO00116 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPSO00116 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPSO00116 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPSO00116 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGPSO00116 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGPSO00116 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGPSO00116 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AGPSO00116 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGPSO00116 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGPSO00116 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGPSO00116 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGPSO00116 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGPSO00116 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGPSO00116 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGPSO00116 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGPSO00116 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGPSO00116 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGPSO00116 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGPSO00116 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AGPSO00116 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGPSO00116 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGPSO00116 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGPSO00116 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms