Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
J3KR12 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
J3KR12 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
J3KR12 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
J3KR12 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
J3KR12 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
J3KR12 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3KR12 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3KR12 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3KR12 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3KR12 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3KR12 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3KR12 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3KR12 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3KR12 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3KR12 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3KR12 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3KR12 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
J3KR12 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3KR12 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3KR12 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3KR12 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3KR12 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
J3KR12 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3KR12 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3KR12 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3KR12 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3KR12 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
J3KR12 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3KR12 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3KR12 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3KR12 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3KR12 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3KR12 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3KR12 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3KR12 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3KR12 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3KR12 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3KR12 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3KR12 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3KR12 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
J3KR12 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3KR12 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3KR12 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3KR12 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3KR12 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
J3KR12 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3KR12 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
J3KR12 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3KR12 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3KR12 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3KR12 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3KR12 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3KR12 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3KR12 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3KR12 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3KR12 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3KR12 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3KR12 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3KR12 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3KR12 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
J3KR12 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
J3KR12 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3KR12 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3KR12 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3KR12 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3KR12 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3KR12 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3KR12 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3KR12 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3KR12 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3KR12 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3KR12 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3KR12 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3KR12 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
J3KR12 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3KR12 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
J3KR12 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3KR12 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3KR12 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3KR12 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3KR12 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3KR12 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
J3KR12 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3KR12 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3KR12 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3KR12 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3KR12 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3KR12 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3KR12 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3KR12 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3KR12 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3KR12 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3KR12 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
J3KR12 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3KR12 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3KR12 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3KR12 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3KR12 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
J3KR12 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms