Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
B4DXG7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DXG7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DXG7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DXG7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DXG7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DXG7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DXG7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DXG7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DXG7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DXG7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DXG7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DXG7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DXG7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DXG7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DXG7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DXG7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DXG7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DXG7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DXG7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DXG7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DXG7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DXG7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DXG7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DXG7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DXG7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DXG7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DXG7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DXG7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DXG7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DXG7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DXG7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DXG7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DXG7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DXG7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DXG7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DXG7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DXG7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DXG7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DXG7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DXG7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DXG7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DXG7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DXG7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DXG7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DXG7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DXG7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DXG7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DXG7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DXG7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DXG7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DXG7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DXG7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DXG7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DXG7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DXG7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DXG7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DXG7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DXG7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DXG7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DXG7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DXG7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DXG7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DXG7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DXG7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DXG7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DXG7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DXG7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DXG7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DXG7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DXG7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B4DXG7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DXG7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DXG7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DXG7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DXG7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DXG7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DXG7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DXG7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DXG7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DXG7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DXG7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DXG7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B4DXG7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DXG7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DXG7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DXG7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DXG7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DXG7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DXG7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DXG7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DXG7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DXG7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DXG7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
B4DXG7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
B4DXG7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
B4DXG7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
B4DXG7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
B4DXG7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
B4DXG7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms