Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGB1P1B2RPK0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms