Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF839A8K0R7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF839A8K0R7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms