Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP27XA6NNY8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP27XA6NNY8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms