Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD3A6NKT7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms