Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC69A6NI79 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms