Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C9orf92A6NGG3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms