Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL33A6NCF5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms