Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 MT1F-201ENST00000334350 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ALX1-201ENST00000316824 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CPEB1-212ENST00000616959 2009 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 TBC1D3I-201ENST00000616671 1982 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CITED1-206ENST00000431381 941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CPSF4-206ENST00000441580 942 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CITED1-207ENST00000445983 820 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 RN7SL678P-201ENST00000579533 299 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ALOX5-207ENST00000542434 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 TAF11-202ENST00000420584 1465 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 MAGEA11-202ENST00000355220 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 TSGA10-201ENST00000355053 3037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms